大約300萬年前，菲律賓板塊與歐亞板塊發生擠壓，台灣經由這一次的激烈碰撞，才由海底浮出海面……10多年前學生時代教科書裡教授的常識，幾乎已還給老師，台灣地層的演變，和每日庸庸碌碌的生活根本搭不上一點關連，直到來到樟湖，觸摸到深嵌岩面的貝殼化石，才真切地感受到，教科書中更新世的變動，是真真實實存在過。

講到遠古時代，講到化石，大家第一聯想就是恐龍，不過，台灣沒有恐龍的足跡，因為台灣原本是沈在海面之下，在恐龍滅絕後，台灣才由海底升起來；化石會說話，說的就是台灣原本是在海面下的歷史，地層出現什麼化石，代表的是台灣是什麼時候浮起，而當時在海面下的深度又是如何。

樟湖地區的化石，是以海扇貝類為主，也有一些海膽、單體珊瑚和有孔蟲及一些生痕化石。


生痕化石，阿亮的名言，「凡走過必留下痕跡」，生痕化石就是動物曾經走過這裡的證據，也許是足印，也許是糞便。

根據地質學者的研究，扇貝、海膽、珊瑚這些化石的出現，說的是當時的台灣是在淺海的環境，因為這些都是在淺海水域生活的生物，而此區所在的深度大約是海面下幾公尺到幾十公尺；台灣的南北深度不同，南部所在深度比北部深，所以才會有泥火山之類的地形出現。

樟湖貝化石區，推斷其年代，大約距今700萬～800萬年前，屬中新世晚期到上新世早期，其岩層為桂竹林層，為砂岩和頁岩所組成。

位於內湖溪注入清水溪河床上的樟湖貝化石區，發現的時間很早，成為觀光區也有相當長的一段時間，但一直處於開放狀態，在發現之初，經由地質學家調查，貝類化石層大約有30公分厚。

不過，現場環境並不利於樟湖化石區的保存，這片裸露於河床上的化石區，雨季河水暴漲時，就不可避免地會遭到河水沖涮，而在河水量小時，又有人為的踩踏、破壞，甚至在現場烤肉，不但如此，許多外型完整的貝殻，都已被自私的遊客挖走，經過長期的破壞，這個化石層已愈來愈薄。

和樟湖一樣，擁有密集貝類化石的地區，還有苗栗通霄、白沙屯一帶，這3個地區都是地質學家的研究重點，但都和樟湖一樣，雖然化石區對於台灣地層演變具有相當大的見證意義，不過，直到現在仍然沒有任何的保護措施。

樟湖風景區，位於通往草嶺的149甲縣道上；前往貝化石區除了不要破壞現場環境，也要注意自身安全，雨季時需嚴防溪水暴漲，此區表面地層也不穩定，大雨或地震之後也常會有大石從山崖滑落。