严谨说，奇门遁甲依功能不同可分三派，一是「法术奇门」，二是「方位奇门」，三是「占卜奇门」。

《法术奇门》是偏向玄学符箓的应用，本身具有神秘色彩，常见施法者手持剑诀，脚踩七星阵，进行划符念咒的仪式，或施行土遁、云遁、水遁...等神秘的阵法，包括日本忍术，据传也是由中国《法术奇门》流传过去的。
《法术奇门》虽充满神秘色彩，但据纪晓岚《阅微草堂笔记》记载，它在传至宋清远时，就已失佚了，后人既使有人学会，也是从残篇断简中拚凑出来，可信度不高，所以至今仍旧成迷。

而《方位奇门》与《占卜奇门》则是目前奇门遁甲较流行的二门科目，尤其是《方位奇门》，更是整部奇门遁甲精华所在，据加拿大易经学院研究显示，它可说一部理论架构相当完备的时空磁场学，由于实用度高，自古以来，就广受人们喜爱，尤其历代军事家用之行军布局颇多，如果牛刀小试将它用在现代人身上，方位奇门更可突显其多采多姿的应用性，不管是第一次出门、求财、约会、购物、推销、旅游、谈判、休闲、健康...等，都可利用方位移动所造成的奇门感应，来帮助现代人心想事成，万事如意，来达到真正造福人群的实务。